Медитация в Кундалини йоге - это составляющая часть практики, 
главная её часть. Дыхательные упражнения, физические крии готовят практикующего к медитации. Считается что медитация останавливает мысли, но это не так. Наш ум – это генератор мыслей, только какие это мысли? Чистые, светлые, ясные? Или мутные, темные, спутанные? В медитациях наши мысли существуют, но мы учимся не быть привязанными к ним, не реагировать на них. Когда мы позволяем мыслям просто течь, наш ум достигает такого состояния, когда мы чувствует себя спокойно. Медитации Кундалини-йоги делают ум благостным. И даже, если во время медитации Вы вдруг начинаете плакать, сердится, это нестрашно. Это рвётся из Вас наружу та боль, те обиды, огорчения, страхи, которые Вы приобрели в раннем детстве или юности. Позвольте им уйти, освободитесь от всего, что так тяготит Вас, и вы обретёте гармонию и блаженство.
Во многих медитациях используются мантры. Мантра – это слово, несущее звук, который соединяет нас с вибрациями Бесконечного, Божественного. Повторяя многократно этот звук, мы пробуждаем и очищаем свои ум и сознание, способствуем позитивным переменам в себе, высвобождаем скрытый потенциал, обретаем опыт переживания Бога и Бесконечности. Когда мы произносим мантру вслух или про себя, мы фокусируемся на позитивном божественном звуке, который прорывается через негативность подсознательного ума.
Время медитаций чаще определяется, но иногда оно может быть произвольным. Обычно время для медитации - 3мин, 11мин, 22мин, 31мин, 62мин, 2,5часа. Позитивные перемены в эндокринной системе наступают через 3мин. Гипофиз и нервная система стимулируются за 11мин. Три ментальных тела приходят в баланс за 22мин. Весь ум, аура и элементы связанные с пятью нижними чакрами уравновешиваются за 31мин. Внутреннее Я и внешние проекции балансируются за 62мин. И 2,5часа практики оказывают своё благотворное влияние на весь последующий день на все духовные практики, которыми вы занимаетесь.